El Puerto de Santa María se localiza al suroeste de la Comunidad Autónoma de Andalucía, en la provincia de Cádiz.
Limita con ciudades como Puerto Real, Sanlúcar, Rota y Jerez de la Frontera, pasando a ser el corazón de la Bahía de Cádiz y, por tanto el centro neurálgico de ésta por lo que cuenta con una magnífica red de comunicaciones.
Con una extensión de 15.900 hectáreas, se pueden distinguir distintas unidades físicas dentro de su territorio: la zona de las marismas, que debido a su valor ecológico han sido incluidas como Parque Natural dentro de la Red de Espacios Naturales Protegidos de Andalucía, el campo de dunas de la costa suroeste, la sierra de San Cristóbal (desde la que se domina toda la Bahía de Cádiz, la Sierra Gaditana y la campiña de Jerez. Destacan los 16 kilómetros de litoral –la mayor parte de ellos de playas bajas y arenosas-.

El Puerto de Santa María cuenta con una buena red de infraestructuras, que facilitan su conexión con numerosas ciudades y capitales.
Por carretera, las principales vías de comunicación que unen a la Ciudad con el resto de Andalucía son:
la Autopista A-IV, que une Sevilla – Cádiz,
la Carretera Nacional IV, que une Madrid – Cádiz,
La Carretera Nacional 340, que la une con la costa mediterránea de la península
La Carretera Nacional 342, a través de la Sierra de Cádiz la une con la Andalucía del interior
La Autovía, A-491, que la une con Rota y Chipiona
La Carretera A- 2001 que la une con Sanlúcar de Barrameda
Se están llevando a cabo numerosas obras para mejorar la calidad de las vías, como la reciente obra de conversión del tramo de Carretera Nacional IV que cruzaba la Ciudad en Travesía o el cercano proyecto de unir la Autovía A- 491 con la Autovía A-4 que recorre gran parte de las poblaciones costeras de la provincia de Cádiz.

El Aeropuerto de Jerez de la Frontera (XRY), se encuentra a tan sólo 21 kms. de El Puerto de Santa María. Tiene conexiones regulares con Madrid y Barcelona. Diferentes compañías europeas realizan vuelos directos en días concretos de la semana con capitales como: Frankfurt, Dusseldorf, Berlin, Munich, Londres, Paris, Ginebra, etc. Se aconseja para una información concreta, contactar directamente con el Aeropuerto de Jerez ya que estos vuelos pueden cambiar el día o el horario.
El Aeropuerto de Sevilla-San Pablo, se encuentra a 110 kms. de la Ciudad, con vuelos directos a las principales capitales españolas y del extranjero. Oficina de Ventas y Reservas: 954 218 800. Desde el aeropuerto hay con frecuencia autobuses hasta Sevilla, una de las paradas la realiza frente a la Estación de Trenes Santa Justa desde donde cada dos horas aproximadamente salen regionales en dirección a la Ciudad.
El Aeropuerto de Gibraltar, se encuentra a unos 140 kms. de la Ciudad y su teléfono es el siguiente: 956 773 026.

Numerosas líneas de autobús paran en El Puerto de Santa María procedente de las distintas poblaciones de la provincia de Cádiz.

Compañía de Transportes Comes: 956. 807. 059
Compañía Los Amarillos: 956. 290.800
Secorbús, línea procedente de Madrid: 902.229.29

La ciudad también está conectada por ferrocarril; la estación de tren se encuentra situada en el casco histórico, y como obras más importantes destaca el proyecto de la llegada del AVE hasta la Ciudad de Cádiz, pasando por El Puerto de Santa María.
Líneas directas desde El Puerto de Santa María a Sevilla, Córdoba, Madrid, Zaragoza y Barcelona. Cercanías a diferentes poblaciones de la provincia.
El Servicio Marítimo prestado por la empresa Motonaves Adriano SL que une las ciudades de El Puerto de Santa María y Cádiz.
Catamaranes que parten de la Estación Marítima portuense y hacen el servicio El Puerto- Cádiz, Cádiz- Rota, Rota-El Puerto y Cádiz- El Puerto.